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线上讲座 | 单细胞空间转录组专题——实验技术和前沿应用

百奥智汇 单细胞天地 2022-06-07

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空间转录组点阵图,源于10x Genomics官网

近年来,空间转录组测序技术以其能够捕获细胞的空间特异性信息而受到强烈关注,并被广泛应用于癌症、发育生物学等领域的研究中。

在此前举办的百奥智汇单细胞云课堂中,我们的高级生信科学家已对空间转录组测序的分析方法进行过解析,得到了老师和同学们的一致好评。

为了让大家更加详细地了解该技术,8月17日-18日,百奥智汇将举办空间转录组线上专题讲座从实验到应用,带大家全面了解该技术,帮助大家加深理解,从而能够尽快地将其纳入到自己的科研思考体系中,更早地利用起这一研究利器。


通过本次讲座,你将能够了解到:
  • 空间转录组的技术原理
  • 空间转录组的实验方案
  • 空间转录组在肿瘤研究中的应用
  • 空间转录组在发育生物学中的应用
  • 如何利用转录组数据获得细胞空间信息
              
8月17日,担任主讲的是百奥智汇基因组部负责人高染染经理和高级产品经理王凌宇博士,他们将对空间转录组的技术原理、实验细节、前沿应用等进行介绍。

8月18日,我们有幸邀请到了北京大学副研究员任仙文博士作为嘉宾,分享他的最新研究成果——细胞空间关系算法CSOmap,该方法的相关论文由任博士于今年6月15日以第一作者的身份发表《Cell Research》上

嘉宾简介


任仙文博士
  • 北京大学副研究员,中科院运筹学与控制论博士

  • 曾于中国医学科学院病原生物学研究所任助理研究员、副研究员,从事宏基因组测序数据的生物信息分析,参与完成了中国蝙蝠类、啮齿类动物携带病毒谱的扫描,发现了数百种新病毒,包括新SARS-like冠状病毒、MERS-like冠状病毒、Henipa-like病毒,相关研究被Science杂志特别评论,相关技术获得专利授权并应用于临床

  • 2014年获颁“协和新星”荣誉称号,2016年获得教育部科技进步一等奖。

  • 2016年加入北京大学,致力于单细胞转录组测序的生物信息学分析和肿瘤免疫的研究,针对大规模单细胞测序数据的聚类问题、单细胞组织分布的定量问题、发育路径和跨组织迁移等动态行为的推测问题等重要前沿生物信息学问题提出了关键技术创新。

  • 在 Cell、Nature、Nature Medicine、Genome Biology、Nucleic Acids Research、Bioinformatics 等国际知名学术期刊上发表论文40余篇,其中第一作者或通讯作者论文30篇,并担任Frontiers in Genetics等杂志编辑。



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